Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNDQ07001 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNDQ07001 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms