Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1DQ01668 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1DQ01668 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms