Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms