Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms