Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113P62684 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms