Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB4BP61018 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB4BP61018 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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RAB4BP61018 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB4BP61018 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB4BP61018 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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RAB4BP61018 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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RAB4BP61018 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB4BP61018 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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