Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLRP6P59044 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms