Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB25P57735 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB25P57735 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB25P57735 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB25P57735 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB25P57735 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB25P57735 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB25P57735 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms