Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF3P57682 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF3P57682 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms