Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIPK4P57078 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms