Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms