Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AMPHP49418 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AMPHP49418 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AMPHP49418 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AMPHP49418 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms