Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PITPNBP48739 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms