Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTR1BP42025 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms