Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PBX2P40425 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PBX2P40425 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PBX2P40425 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PBX2P40425 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PBX2P40425 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PBX2P40425 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PBX2P40425 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PBX2P40425 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PBX2P40425 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PBX2P40425 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PBX2P40425 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PBX2P40425 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PBX2P40425 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PBX2P40425 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PBX2P40425 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms