Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB2P35606 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB2P35606 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPB2P35606 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPB2P35606 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPB2P35606 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPB2P35606 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPB2P35606 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPB2P35606 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms