Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCGF2P35227 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms