Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBP2P32456 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBP2P32456 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP2P32456 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP2P32456 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP2P32456 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP2P32456 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP2P32456 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP2P32456 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP2P32456 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP2P32456 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms