Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOBEC3AP31941 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms