Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA7P31268 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms