Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA5P30532 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA5P30532 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms