Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGA1P29973 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms