Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2E1P29083 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms