Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTX3P26022 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTX3P26022 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTX3P26022 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTX3P26022 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms