Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP5F1P24539 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms