Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP2B4P23634 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP2B4P23634 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms