Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GCSHP23434 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GCSHP23434 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GCSHP23434 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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