Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
USF1P22415 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
USF1P22415 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USF1P22415 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF1P22415 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF1P22415 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF1P22415 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF1P22415 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USF1P22415 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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