Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCLP19338 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCLP19338 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCLP19338 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCLP19338 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCLP19338 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCLP19338 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCLP19338 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCLP19338 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCLP19338 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCLP19338 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCLP19338 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCLP19338 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms