Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATF3P18847 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATF3P18847 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATF3P18847 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF3P18847 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF3P18847 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF3P18847 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF3P18847 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF3P18847 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF3P18847 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF3P18847 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF3P18847 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms