Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGB4P16144 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms