Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSPP15924 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSPP15924 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DSPP15924 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSPP15924 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms