Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA1P14867 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms