Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms