Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CFTRP13569 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CFTRP13569 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CFTRP13569 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CFTRP13569 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CFTRP13569 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
CFTRP13569 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CFTRP13569 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CFTRP13569 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFTRP13569 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CFTRP13569 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CFTRP13569 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CFTRP13569 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CFTRP13569 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CFTRP13569 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CFTRP13569 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CFTRP13569 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms