Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms