Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms