Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A1P11836 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms