Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMIGD3P0DMS9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms