Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms