Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RHOP08100 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RHOP08100 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RHOP08100 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RHOP08100 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHOP08100 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHOP08100 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHOP08100 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHOP08100 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHOP08100 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHOP08100 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHOP08100 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RHOP08100 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms