Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX58O95786 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX58O95786 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX58O95786 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX58O95786 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX58O95786 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX58O95786 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX58O95786 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX58O95786 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX58O95786 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX58O95786 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDX58O95786 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
DDX58O95786 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX58O95786 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms