Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1O95476 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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