Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALX3O95076 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALX3O95076 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALX3O95076 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ALX3O95076 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms