Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGR3O43761 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms