Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDM6AO15550 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDM6AO15550 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms