Protein–RNA interactions for Protein: O00110

OVOL3, Putative transcription factor ovo-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OVOL3O00110 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OVOL3O00110 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms