Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms