Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E9PCH4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E9PCH4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E9PCH4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
E9PCH4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E9PCH4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E9PCH4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
E9PCH4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
E9PCH4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
E9PCH4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
E9PCH4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
E9PCH4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
E9PCH4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
E9PCH4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
E9PCH4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
E9PCH4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PCH4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PCH4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PCH4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PCH4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PCH4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PCH4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PCH4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PCH4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PCH4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PCH4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PCH4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PCH4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PCH4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PCH4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PCH4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PCH4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PCH4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PCH4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PCH4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PCH4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PCH4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PCH4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PCH4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PCH4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PCH4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PCH4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms