Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP18Q9UMW8 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP18Q9UMW8 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP18Q9UMW8 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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USP18Q9UMW8 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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USP18Q9UMW8 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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USP18Q9UMW8 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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USP18Q9UMW8 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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USP18Q9UMW8 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
USP18Q9UMW8 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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